Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
| Material |
Dauer |
Akkreditierung |
| 3 - 5 ml EDTA-Blut |
3 - 5 Wochen |
ja |
Untersuchte Bereiche / Gene
| Genotyp |
OMIM-P |
Erbgang |
Phänotyp |
Methodik |
| ARR3 |
301010
|
XL |
Hohe Myopie (MYP26) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CACNA1F |
300071
|
XL |
Nachtblindheit und Myopie (CSNB2A) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CNGB3 |
262300
|
AR |
Farbenblindheit und Myopie (ACHM3) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| COL2A1 |
108300
|
AD |
Stickler-Syndrom (STL1) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| COL9A1 |
614134
|
AR |
Stickler-Syndrom (STL4) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| COL9A2 |
614284
|
AR |
Stickler-Syndrom (STL5) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| COL9A3 |
620022
|
AR |
Stickler-Syndrom (STL6) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| COL11A1 |
604841
|
AD |
Stickler-Syndrom (STL2) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| COL18A1 |
267750
|
AR |
Knobloch-Syndrom (KNO1) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CPSF1 |
618827
|
AD |
Hohe Myopie (MYP27) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GPR179 |
614565
|
AR |
Nachtblindheit und Myopie (CSNB1E) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GRM6 |
257270
|
AR |
Nachtblindheit und Myopie (CSNB1B) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GZF1 |
617662
|
AR |
Gelenk-Hyperlaxität, Kleinwuchs und Myopie (JLSM) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| IRX5 |
611174
|
AR |
Hamamy-Syndrom (HMMS) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| LOXL3 |
619781
|
AR |
Hohe Myopie (MYP28) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| LRP2 |
222448
|
AR |
Donnai-Barrow-Syndrom (DBS) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| LRPAP1 |
615432
|
AR |
Hohe Myopie (MYP23) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| NYX |
310500
|
XLR |
Nachtblindheit und Myopie (CSNB1A) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| P3H2 |
614292
|
AR |
Vitreoretinale Degeneration, Katarakt und Myopie (MCVD) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| P4HA2 |
617238
|
AD |
Hohe Myopie (MYP25) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| PRIMPOL |
615420
|
AD |
Hohe Myopie (MYP22) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| SCO2 |
608908
|
AD |
Hohe Myopie (MYP6) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| SLC39A5 |
615946
|
AD |
Hohe Myopie (MYP24) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| SLITRK6 |
221200
|
AR |
Schwerhörigkeit und Myopie (DFNMYP) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| ZNF644 |
614167
|
AD |
Hohe Myopie (MYP21) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025).
Library: Capture based TWIST Library
Sequenzierung:
Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer
Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte).
Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind.
Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hohe Myopie (MYP)
ARR3,
CACNA1F,
CNGB3,
COL11A1,
COL18A1,
COL2A1,
COL9A1,
COL9A2,
COL9A3,
CPSF1,
GPR179,
GRM6,
GZF1,
IRX5,
LOXL3,
LRP2,
LRPAP1,
NYX,
P3H2,
P4HA2,
PRIMPOL,
SCO2,
SLC39A5,
SLITRK6,
ZNF644
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant.
Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ARR3, CACNA1F, CNGB3, COL11A1, COL18A1, COL2A1, COL9A1, COL9A2, COL9A3, CPSF1, GPR179, GRM6, GZF1, IRX5, LOXL3, LRP2, LRPAP1, NYX, P3H2, P4HA2, PRIMPOL, SCO2, SLC39A5, SLITRK6, ZNF644
HPO Terms
High myopia, Myopia, Severely reduced visual acuity, Reduced visual acuity, Visual impairment, Visual loss, Retinal detachment, Retinal atrophy, Bone spicule pigmentation of the retina, Attenuation of retinal blood vessels, Macular degeneration, Photopsia, Central scotoma, Cone/cone‑rod dystrophy, Retinal dystrophy, Vitreoretinopathy, Abnormal macular morphology, Retinal thinning, Abnormal fundus, Abnormal electroretinogram