Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
| Material |
Dauer |
Akkreditierung |
| 3 - 5 ml EDTA-Blut |
3 - 5 Wochen |
ja |
Untersuchte Bereiche / Gene
| Genotyp |
OMIM-P |
Erbgang |
Phänotyp |
Methodik |
| CACNA1F |
300071
|
XL |
CSNB2A |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GNAT1 |
616389
|
AR |
CSNB1G |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GNAT1 |
610444
|
AD |
CSNBAD3 |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GNB3 |
617024
|
AR |
CSNB1H |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GPR179 |
614565
|
AR |
CSNB1E |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GRK1 |
613411
|
AR |
CSNBO2, Typ Oguchi |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GRM6 |
257270
|
AR |
CSNB1B |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GUCY2D |
618555
|
AR |
CSNB1I |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| LRIT3 |
615058
|
AR |
CSNB1F |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| NYX |
310500
|
XLR |
CSNB1A |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| PDE6B |
163500
|
AD |
CSNBAD2 |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| RHO |
610445
|
AD |
CSNBAD1 |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| SAG |
258100
|
AR |
CSNBO1, Typ Oguchi |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| SLC24A1 |
613830
|
AR |
CSNB1D |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| TRPM1 |
613216
|
AR |
CSNB1C |
SNV und CNV: Short Read NGS |
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025).
Library: Capture based TWIST Library
Sequenzierung:
Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer
Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte).
Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind.
Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kongenitale stationäre Nachtblindheit (CSNB)
CACNA1F,
GNAT1,
GNAT1,
GNB3,
GPR179,
GRK1,
GRM6,
GUCY2D,
LRIT3,
NYX,
PDE6B,
RHO,
SAG,
SLC24A1,
TRPM1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant.
Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
CACNA1F, GNAT1, GNB3, GPR179, GRK1, GRM6, GUCY2D, LRIT3, NYX, PDE6B, RHO, SAG, SLC24A1, TRPM1
HPO Terms
Congenital stationary night blindness, Congenital stationary night blindness with normal fundus, Congenital stationary night blindness with abnormal fundus, Nyctalopia, Reduced visual acuity, Abnormal dark-adapted electroretinogram, Abnormal light- and dark-adapted electroretinogram, Reduced amplitude of dark-adapted bright flash electroretinogram a-wave, Abnormal amplitude of light-adapted flicker electroretinogram, Abnormal full-field electroretinogram, Abnormal electroretinogram, Difficulty adjusting from light to dark, Photophobia, X-linked inheritance, X-linked recessive inheritance, Autosomal recessive inheritance, Autosomal dominant inheritance, Nystagmus, Strabismus, Horizontal nystagmus