Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
| Material |
Dauer |
Akkreditierung |
| 3 - 5 ml EDTA-Blut |
3 - 5 Wochen |
ja |
Untersuchte Bereiche / Gene
| Genotyp |
OMIM-P |
Erbgang |
Phänotyp |
Methodik |
| BTK |
307200
|
XLR |
Isolierter Wachstumshormonmangel (IGHD3) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GH1 |
262400
|
AR |
Isolierter Wachstumshormonmangel (IGHD1A) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GH1 |
612781
|
AR |
Isolierter Wachstumshormonmangel (IGHD1B) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GH1 |
173100
|
AD |
Isolierter Wachstumshormonmangel (IGHD2) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GHRHR |
618157
|
AR |
Isolierter Wachstumshormonmangel (IGHD4) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GHSR |
615925
|
AD, AR |
Isolierter Wachstumshormonmangel, partiell (GHDP) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GLI2 |
615849
|
AD |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| HESX1 |
182230
|
AD, AR |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD5) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| IGSF10 |
617351
|
AD |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| LHX3 |
221750
|
AR |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD3) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| LHX4 |
262700
|
AD |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD4) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| OTX2 |
613986
|
AD |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD6) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| POU1F1 |
613038
|
AD, AR |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD1) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| PROP1 |
262600
|
AR |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD2) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| RNPC3 |
618160
|
AR |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD7) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| SEMA3A |
614897
|
AD |
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| SOX3 |
300123
|
XL |
Isolierter Wachstumshormonmangel und Mentale Retardierung (MRGH) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025).
Library: Capture based TWIST Library
Sequenzierung:
Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer
Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte).
Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind.
Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Isolierter Wachstumshormonmangel (IGHD)
BTK,
GH1,
GHRHR,
GHSR,
SOX3
Kombinierter Hypophysenhormonmangel (CPHD)
GLI2,
HESX1,
IGSF10,
LHX3,
LHX4,
OTX2,
POU1F1,
PROP1,
RNPC3,
SEMA3A
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant.
Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
BTK, GH1, GHRHR, GHSR, GLI2, HESX1, IGSF10, LHX3, LHX4, OTX2, POU1F1, PROP1, RNPC3, ROBO1, SEMA3A, SOX3
HPO Terms
Short stature, Severe short stature, Growth delay, Growth retardation, Growth hormone deficiency, Reduced circulating growth hormone concentration, Decreased circulating IGF‑1 concentration, Decreased response to growth hormone stimulation test, Pituitary hypoplasia, Anterior pituitary agenesis, Ectopic pituitary, Small sella turcica, Delayed bone age, Delayed puberty, Failure to thrive, Delayed skeletal maturation, Pituitary dwarfism, Reduced IGF‑1 concentration, Hypoplasia of the pituitary gland, Pituitary hormone deficiency