Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
| Material |
Dauer |
Akkreditierung |
| 3 - 5 ml EDTA-Blut |
3 - 5 Wochen |
ja |
Untersuchte Bereiche / Gene
| Genotyp |
OMIM-P |
Erbgang |
Phänotyp |
Methodik |
| ACVR2B |
613751
|
AD |
Viszerale Heterotaxie (HTX4) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CFAP45 |
619608
|
AR |
Viszerale Heterotaxie (HTX11) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CFAP52 |
619607
|
AR |
Viszerale Heterotaxie (HTX10) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CFAP53 |
614779
|
AR |
Viszerale Heterotaxie (HTX6) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CFC1 |
605376
|
AD |
Viszerale Heterotaxie (HTX2) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CIROP |
619702
|
AR |
Viszerale Heterotaxie (HTX12) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CRELD1 |
606217
|
AD |
Septumdefekt mit Heterotaxie |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| DNAAF1 |
613193
|
AR |
Primäre Ziliendyskinesie und Heterotaxie (CILD13) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| DNAH5 |
608644
|
AR |
Primäre Ziliendyskinesie und Heterotaxie (CILD3) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| DNAH9 |
618300
|
AR |
Primäre Ziliendyskinesie und Heterotaxie (CILD40) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| DNAH11 |
611884
|
AR |
Primäre Ziliendyskinesie und Heterotaxie (CILD7) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GDF1 |
208530
|
AR |
Viszeroatriale Heterotaxie |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| MMP21 |
616749
|
AR |
Viszerale Heterotaxie (HTX7) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| MNS1 |
618948
|
AR |
Viszerale Heterotaxie (HTX9) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| NODAL |
270100
|
AD |
Viszerale Heterotaxie (HTX5) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| ODAD2 |
615408
|
AR |
Primäre Ziliendyskinesie und Heterotaxie (CILD23) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| PKD1L1 |
617205
|
AR |
Viszerale Heterotaxie (HTX8) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| ZIC3 |
306955
|
XLR |
Viszerale Heterotaxie (HTX1) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025).
Library: Capture based TWIST Library
Sequenzierung:
Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer
Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte).
Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind.
Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Viszerale Heterotaxie (HTX)
ACVR2B,
CFAP45,
CFAP52,
CFAP53,
CFC1,
CIROP,
CRELD1,
DNAAF1,
DNAH11,
DNAH5,
DNAH9,
GDF1,
MMP21,
MNS1,
NODAL,
ODAD2,
PKD1L1,
ZIC3
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant.
Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ACVR2B, CFAP45, CFAP52, CFAP53, CFC1, CIROP, CRELD1, DNAAF1, DNAH11, DNAH5, DNAH9, GDF1, MMP21, MNS1, NODAL, ODAD2, PKD1L1, ZIC3
HPO Terms
Heterotaxy, Asplenia, Polysplenia, Left isomerism, Right isomerism, Situs inversus totalis, Atrial situs ambiguous, Abnormal atrial arrangement, Abnormal inferior vena cava morphology, Bilateral superior vena cava, Persistent left superior vena cava, Intestinal malrotation, Duodenal atresia, Common atrium, Complete atrioventricular canal defect, Transposition of the great arteries, Double outlet right ventricle, Hypoplastic left heart, Ventricular septal defect, Patent ductus arteriosus