Leistungsverzeichnis - Mikrozephalie, umfassende Diagnostik : 129 Gene (371,601 kb)

Material	Dauer	Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut	4 - 6 Wochen	ja

Untersuchte Bereiche / Gene

ADARB1

ANKLE2

ARCN1

ARFGEF2

ASPM

ATR

BLM

CARS1

CASK

CDK5RAP2

CDK6

CENPE

CENPF

CENPT

CEP63

CEP135

CEP152

CIT

CKAP2L

COPB1

COPB2

CPAP

CRIPT

CTNNB1

CTU2

DIAPH1

DNA2

DNMT3A

DONSON

DPP6

DYNC1I2

DYRK1A

EFTUD2

EIF2S3

ERCC1

ERCC2

ERCC5

ERCC6

EXOC8

EXT2

FOXG1

GEMIN4

GPT2

IER3IP1

KAT6A

KATNB1

KCNA4

KIF11

KIF14

KNL1

LAGE3

LMNB1

LMNB2

MCPH1

MED17

MFSD2A

MSMO1

MTHFS

MYCN

NARS1

NBN

NCAPD2

NCAPD3

NCAPH

NDE1

NHEJ1

NIN

NSMCE2

NUP37

NUP107

NUP133

OCLN

OSGEP

PCDH12

PCNT

PHC1

PHGDH

PLAA

PLEKHG2

PLK4

PNKP

PPP1R15B

PQBP1

PRUNE1

PSAT1

PUS3

PUS7

QARS1

RAB3GAP1

RAB3GAP2

RAB18

RAD50

RBBP8

RTTN

SARS1

SASS6

SLC1A4

SLC9A6

SLC25A19

SMPD4

SPOP

STAG2

STAMBP

STIL

SVBP

TBC1D20

THOC6

TMX2

TOP3A

TP53RK

TPRKB

TRAIP

TRAPPC6B

TRAPPC14

TRIO

TRMT10A

TUBGCP2

TUBGCP4

TUBGCP6

VARS1

VPS13B

WDFY3

WDR4

WDR62

WDR73

XRCC4

YIPF5

ZEB2

ZNF335

Methodik

ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.

Primäre Mikrozephalie (MCPH)

ANKLE2, ASPM, CDK5RAP2, CDK6, CENPE, CEP135, CEP152, CIT, COPB2, CPAP, KIF14, KNL1, MCPH1, MFSD2A, NCAPD2, NCAPD3, NCAPH, NUP37, PHC1, SASS6, STIL, TRAPPC14, WDFY3, WDR62, ZNF335

Seckel-Syndrom (SCKL)

ATR, CEP152, CEP63, CPAP, DNA2, NIN, NSMCE2, RBBP8, TRAIP

Warburg-Mikro-Syndrom (WARBM)

RAB18, RAB3GAP1, RAB3GAP2, TBC1D20

Galloway-Mowat-Syndrom (GAMOS)

LAGE3, NUP107, NUP133, OSGEP, TP53RK, TPRKB, WDR4, WDR73

Zerebrookulofazioskelettales Syndrom (COFS)

ERCC1, ERCC2, ERCC5, ERCC6

Mikrozephalie und Chorioretinopathie (MCCRP)

KIF11, PLK4, TUBGCP4, TUBGCP6

Neurologische Entwicklungsstörung mit Mikrozephalie (NEDM)

ADARB1, COPB1, CTNNB1, DYNC1I2, EXOC8, GEMIN4, GPT2, MFSD2A, MTHFS, NARS1, PLAA, PRUNE1, PUS3, SARS1, SMPD4, SPOP, STAG2, SVBP, TMX2, TRAPPC6B, VARS1

Kosten

Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.

Gesamte Genliste

ADARB1, ANKLE2, ARCN1, ARFGEF2, ASPM, ATR, BLM, CARS1, CASK, CDK5RAP2, CDK6, CENPE, CENPF, CENPT, CEP135, CEP152, CEP63, CIT, CKAP2L, COPB1, COPB2, CPAP, CRIPT, CTNNB1, CTU2, DIAPH1, DNA2, DNMT3A, DONSON, DPP6, DYNC1I2, DYRK1A, EFTUD2, EIF2S3, ERCC1, ERCC2, ERCC5, ERCC6, EXOC8, EXT2, FOXG1, GEMIN4, GPT2, IER3IP1, KAT6A, KATNB1, KCNA4, KIF11, KIF14, KNL1, LAGE3, LMNB1, LMNB2, MCPH1, MED17, MFSD2A, MSMO1, MTHFS, MYCN, NARS1, NBN, NCAPD2, NCAPD3, NCAPH, NDE1, NHEJ1, NIN, NSMCE2, NUP107, NUP133, NUP37, OCLN, OSGEP, PCDH12, PCNT, PHC1, PHGDH, PLAA, PLEKHG2, PLK4, PNKP, PPP1R15B, PQBP1, PRUNE1, PSAT1, PUS3, PUS7, QARS1, RAB18, RAB3GAP1, RAB3GAP2, RAD50, RBBP8, RTTN, SARS1, SASS6, SLC1A4, SLC25A19, SLC9A6, SMPD4, SPOP, STAG2, STAMBP, STIL, SVBP, TBC1D20, THOC6, TMX2, TOP3A, TP53RK, TPRKB, TRAIP, TRAPPC14, TRAPPC6B, TRIO, TRMT10A, TUBGCP2, TUBGCP4, TUBGCP6, VARS1, VPS13B, WDFY3, WDR4, WDR62, WDR73, XRCC4, YIPF5, ZEB2, ZNF335

HPO Terms

Microcephaly, Abnormal brain MRI, Abnormal brain morphology, Seizure, Speech delay, Developmental delay, Intellectual disability, Growth retardation, Visual impairment, Hearing impairment, Abnormal gait, Abnormal head circumference, Hypotonia, Abnormal head shape, Abnormal brain volume, Cognitive impairment, Abnormal muscle tone, Brain atrophy, Abnormal neurologic examination, Abnormal cognition