Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
| Material |
Dauer |
Akkreditierung |
| 3 - 5 ml EDTA-Blut |
3 - 5 Wochen |
ja |
Untersuchte Bereiche / Gene
| Genotyp |
OMIM-P |
Erbgang |
Phänotyp |
Methodik |
| APOA1 |
620657
|
AD |
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD3) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| APOA2 |
620657
|
AD |
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| APOC2 |
620657
|
AR |
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| APP |
605714
|
AD |
Zerebrale Amyloidangiopathie (HCHWA) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| B2M |
620659
|
AD |
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD6) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| CST3 |
105150
|
AD |
Zerebrale Amyloidangiopathie (HCHWA) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| FGA |
105200
|
AD |
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD2) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GPNMB |
617920
|
AR |
Primäre lokalisierte kutane Amyloidose (PLCA3) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| GSN |
105120
|
AD |
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD4) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| IL31RA |
613955
|
AD |
Primäre lokalisierte kutane Amyloidose (PLCA2) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| ITM2B |
176500
|
AD |
Zerebrale Amyloidangiopathie (HCHWA) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| LYZ |
620658
|
AD |
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD5) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| MEFV |
249100
|
AD |
Familiäres Mittelmeerfieber (FMF) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| NLRP3 |
191900
|
AD |
Muckle-Wells-Syndrom (MWS) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| OSMR |
105250
|
AD |
Primäre lokalisierte kutane Amyloidose (PLCA1) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| PRNP |
137440
|
AD |
Zerebrale Amyloidangiopathie (HCHWA) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| TNFRSF1A |
142680
|
AD |
Familiäres periodisches Fieber (FPF) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
| TTR |
105210
|
AD |
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD1) |
SNV und CNV: Short Read NGS |
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025).
Library: Capture based TWIST Library
Sequenzierung:
Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer
Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte).
Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind.
Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD)
APOA1,
APOA2,
APOC2,
B2M,
FGA,
GSN,
LYZ,
TTR
Primäre lokalisierte kutane Amyloidose (PLCA)
GPNMB,
IL31RA,
OSMR
Zerebrale Amyloidangiopathie (HCHWA)
APP,
CST3,
ITM2B,
PRNP
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant.
Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
APOA1, APOA2, APOC2, APP, B2M, CST3, FGA, GPNMB, GSN, IL31RA, ITM2B, LYZ, MEFV, NLRP3, OSMR, PRNP, TNFRSF1A, TTR
HPO Terms
Generalized amyloid deposition, Amyloidosis, Cardiac amyloidosis, Renal amyloidosis, Hepatic amyloidosis, Cutaneous amyloidosis, Amyloid deposition in vitreous humor, Proteinuria, Nephrotic syndrome, Renal insufficiency, Renal glomerular amyloid deposition, Peripheral neuropathy, Polyneuropathy, Orthostatic hypotension, Abnormal autonomic nervous system physiology, Corneal arcus, Visual impairment, Hepatomegaly, Elevated circulating amyloid A concentration, Hypoalbuminemia